Les infections sexuellement transmissibles (IST) comptent parmi les maladies infectieuses les plus fréquentes dans le monde et sont définies comme des organismes infectieux qui se transmettent entre partenaires sexuels. Selon les Centers for Disease Control (CDC), environ 19 millions de cas sont signalés chaque année avec plus de 20 IST différentes (1). Le virus du papillome humain (VPH) est l’une des causes les plus fréquentes d’IST chez les femmes dans le monde. Il existe plus de 200 génotypes différents de VPH qui sont généralement classés en groupes à haut et à faible risque en fonction de leur risque potentiel de provoquer un cancer. Environ 99% de toutes les tumeurs malignes du col de l’utérus sont dues à un ou plusieurs des types de VPH à haut risque suivants: 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59. Les types à haut risque jouent également un rôle dans d’autres cancers, notamment les cancers de l’anus, de l’oropharynx, de la vulve, du vagin et du pénis.
Le VPH se transmet facilement d’une personne à l’autre par la peau et les muqueuses et, bien qu’elles soient relativement courantes, la majorité des infections sont subcliniques et temporaires en raison de la suppression et de la clairance par un système immunocompétent. La cytologie cervicale et les tests VPH sont largement utilisés pour le dépistage du cancer du col de l’utérus dans les pays où l’accès est facile pour la population, et la détection précoce est donc considérée comme un aspect essentiel de la protection contre ce cancer en particulier.
Le microbiome humain est la somme des micro-organismes qui peuvent résider dans diverses parties du corps, de leur information génétique et de la façon dont ils interagissent avec l’environnement de l’hôte. Alors que nous disposons aujourd’hui d’une quantité importante de données cartographiant le microbiote dans plusieurs sites du corps humain, en particulier l’intestin, des preuves émergentes indiquent que le microbiote vaginal pourrait jouer un rôle clé dans la carcinogenèse du VPH (2) et qu’il est lié à la protection contre la dysbiose ainsi que l’infection par le VPH (3,4).
Chez les femmes en bonne santé en âge de procréer, le pH vaginal est principalement déterminé par les bactéries productrices d’acide lactique, principalement les espèces de lactobacilles. Si les lactobacilles ne dominent pas le microbiote vaginal, les mécanismes de défense antibactérienne de la femme sont compromis (5). Alterations in vaginal microbiota and respective changes in vaginal pH are associated with bacterial vaginosis, Chlamydia trachomatis, trichomoniasis, and urinary tract infections. Cinq grands types d’états communautaires (TEC) dans le vagin ont été décrits (6). Des chercheurs ont étudié le microbiote vaginal de 396 femmes asymptomatiques et ont caractérisé les espèces en cinq groupes sur la base de leurs gènes. Dans un environnement vaginal sain, les TEC I, II, III et V sont dominés par Lactobacillus crispatus, L. gasseri, L. iners et L. jensenii, respectivement. Le TEC IV est caractérisé par une raréfaction des lactobacilles et une diversité accrue de bactéries anaérobies telles que Atopobium (7).
En 2020, une revue systématique extensive des études rapportant des données sur l’association du microbiote et du VPH a été publiée (1). Sur les 78 articles récupérés dans PubMed et 291 dans Scopus, 16 études ont pu être incluses dans l’examen. Ces 16 études ont inclus un total de 1 204 patients. Les microbiotes détectés dans ces études comprenaient plusieurs types de microorganismes: L. iners, qui est classé comme CST III, a été trouvé dans 13 études (72,2%); L. crispatus., une classification CST I, a été trouvé dans 8 études (44,44%) et CST IV-B, qui représente des microbiomes anaérobies combinés avec une réduction de Lactobacillus, a été trouvé dans 5 études (27,7%); Megasphaera, Gardnerella vaginalis, et L. jensenii, qui sont classés comme CST V, ont été trouvés dans 4 études (22. 22%); Sneathia et L. gasseri, classés en CST II ainsi qu’en CST IV-A, représentant Peptoniphilus, Anaerococcus, Cornebacterium, Finegoldia et Prevotella, ont été trouvés dans 2 études (12,5%); et dans une étude chacun (6,25%), dialister, L. formicalis, Fusobacterium, L. gallinarum, et L. salivarus (qui a été trouvé seulement chez les femmes sud-africaines).
Que signifie tout cela concernant l’association du microbiote vaginal avec le VPH et le néoplasie cervicale intraépithéliale (CIN)? Dans l’une des études de la revue, les femmes porteuses du VPH présentaient une plus grande diversité et une plus faible proportion de Lactobacillus avec une prévalence spécifiquement plus faible de L. iners et L. crispatus. Les autres organismes communs chez les femmes séropositives pour le VPH étaient L. gasseri et G. vaginalis. Dans une autre étude, les femmes chez qui on a finalement diagnostiqué une CIN présentaient également une grande diversité de microbiote et étaient généralement colonisées par Sneathia, et chez les femmes atteintes d’un cancer invasif du col de l’utérus, Fusobacterium était le type d’organisme le plus courant. Dans une autre étude incluse dans la revue, on a constaté une abondance de Lactobacillus et de L. reuteri spécifiquement chez les femmes atteintes de CIN II. En revanche, chez les femmes séronégatives, les espèces les plus courantes étaient L. crispatus/CST I et L. gasseri/CST II. L. crispatus semble être lié à la diminution de la prévalence des types oncogènes de HPV et les infections à HPV à haut risque semblent avoir une population réduite de Lactobacillus et une abondance accrue d’anaérobies, en particulier Prevotella et Leptotrichia.
La rémission du VPH est un autre domaine d’intérêt, et dans un rapport inclus, le CST III était le groupe de classification avec la rémission la plus rapide, tandis que le CST IV-B était celui avec la rémission la plus lente, le CST IV-B étant un facteur de risque de persistance du VPH. . Rappelez-vous de ce qui a été dit plus haut dans cet article, dans un environnement vaginal sain, le CST III est dominé par L. iners et le CST IV est caractérisé par un appauvrissement en lactobacilles et une diversité accrue de bactéries anaérobies telles que Atopobium. Le CST IV-A représente Peptoniphilus, Anaerococcus, Corynebacterium, Finegoldia et Prevotella.
Les femmes séronégatives qui deviennent ensuite séropositives peuvent avoir un microbiote CST IV-A plus élevé que celles qui ont un CST I. L. crispatus présente une autre caractéristique remarquable: il s’est avéré être un facteur de protection contre le VIH, le VPH à haut risque et l’herpès simplex de type 2, avec une forte abondance chez les femmes non infectées.
L’origine ethnique est un autre facteur qui affecte fortement le microbiote vaginal. Dans cette revue, les femmes afro-caribéennes ont un risque quatre fois plus élevé de souffrir d’une dysbiose vaginale ou d’une diversité élevée du microbiote, ce qui indique que le CST IV est le type de microbiote le plus courant par rapport aux femmes européennes/caucasiennes et africaines. Même si c’était le cas, la prévalence du VPH et le taux de dysplasie plus sévère n’étaient pas proportionnellement plus élevés, ce qui est surprenant.
En résumé, parmi tout le microbiote, ce sont les Fusobacteria y compris Sneathia comme possibles marqueurs microbiologiques corrélés avec le VPH bien que la relation entre l’infection VPH et la coexistence avec d’autres types de microbiote vaginal soit protectrice ou prédisposante au VPH. L’évolution de l’infection à VPH est en corrélation directe avec l’espèce ou le genre vaginal dominant. L. gasseri, L. jensenii et L. crispatus semblent être protecteurs, tandis que Sneathia, Anaerococcus tetradius, Peptostreptococus, Fusobacterium, G. vaginalis et L. iners, associés à une faible quantité des autres types de Lactobacilles, entraînent des taux élevés d’infection par le VPH, une plus grande gravité de la maladie et des taux plus faibles de rémission du VPH. D’autres facteurs tels que la consommation de nicotine, l’absence de contraception de barrière et un faible taux d’œstrogènes vaginaux peuvent également entraîner des taux élevés d’infection par le VPH. Le lien entre le faible taux d’œstrogènes vaginaux et le microbiome vaginal est également lié à la diminution de la quantité de lactobacilles produisant de l’acide lactique chez les femmes ménopausées.
La plus grande limite de cette étude et de son utilisation clinique est peut-être le fait que nous n’utilisons pas les outils que sont les tests ADN, le séquençage et l’amplification en chaîne par polymérase des gènes, les colorations de Gram, les cultures microbiologiques et le pH vaginal dans notre évaluation et notre gestion habituelles du VPH. En cas d’infection persistante par le VPH et/ou de lésions de haut grade avec récidives en particulier, nous pourrions intégrer au moins certains de ces tests en plus du test ADN VPH, les plus faciles étant le pH vaginal, les colorations de Gram et les cultures microbiologiques. Il existe des tests du microbiome vaginal sur le marché, même certains à usage domestique. L’un d’entre eux s’appelle EVVY. Les méthodes moléculaires de séquençage de nouvelle génération sont utilisées pour caractériser le microbiote vaginal et même un seul échantillon d’écouvillon vaginal, un test d’amplification des acides nucléiques (TAAN), peut détecter de petites quantités d’ADN microbien et évaluer la diversité globale du microbiome vaginal.
En ce qui concerne l’intervention avec les probiotiques et le VPH, nous n’en sommes qu’au début de la compréhension des interventions, mais des espèces particulières, ainsi que des protéines nutraceutiques telles que la lactoferrine, méritent l’attention. Pour l’instant, nous devons faire preuve de créativité en reliant les points et en exerçant notre jugement clinique sur les protocoles, en nous inspirant peut-être de certaines recherches sur les probiotiques vaginaux et la vaginose bactérienne en termes de schémas posologiques. Pour commencer, je vais m’intéresser aux L. crispatus, L. jensenii et L. gasseri vaginaux, ainsi qu’aux tests de dépistage de la vaginose bactérienne et à l’utilisation d’œstrogènes vaginaux chez les femmes ménopausées souffrant d’une infection persistante et/ou récurrente par le VPH ou le CIN, afin d’influencer le microbiote vaginal. Dans d’autres ressources du NFH, par exemple le Women’s Health Clinical Handbook, nous disposons également de données sur l’utilisation de l’extrait de thé vert (oral et suppositoires composés), de Trametes versicolor, de DIM, de sélénium et de folate en cas de cytologie cervicale anormale et de VPH. J’ai développé des protocoles qui sont disponibles dans le manuel.
Références :
- Mortaki D, Gkegkes I, Psomiadou V, et al. Microbiote vaginal et papillomavirus humain : une étude systématique. J Turk Ger Gynecol Assoc 2020; 21:193-200.
- Krygiou M, Mitra A, Moscicki A. Does the vaginal microbiota play a role in the development of cervcal cancer. Transl Res 2017; 179: 168-182.
- An de Wijgert J, Borgdorff H, Verhelst R, et al. Le microbiote vaginal : qu’avons-nous appris après une décennie de chaeractérisation moléculaire ? PLoS One 2014;9:e105998.
- Brotman R. Vaginal microbiome and sexually transmitted infections: an epidemiologic perspective. J Clin Invest 2011;121: 4610-7.
- Linhares I, Summers P, Larsen B, et al. Perspectives contemporaines sur le pH vaginal et les lactobacilles. Am J Obstet Gynecol 2011;204:120.
- Ravel J, Gajer P, Abdo Z, et al. Mirobiome vaginal des femmes en âge de procréer. Proc Natl Acad Sci USA 2011; 108 (Suppl 1): 4680-7.
- Mortaki D, Gkegkes I, Psomiadou V, et al. Microbiote vaginal et papillomavirus humain : une étude systématique. J Turk Ger Gynecol Assoc 2020; 21:193-200.
